Все ресурсы, а также сцены и объекты вашего проекта хранятся на диске. Когда вы редактируете игру, эти объекты загружаются в память, после чего сохраняются снова на диске посредством специальной системы сериализации, которая предусмотрена в Unity. Во время тестовых прогонов игры, находящиеся в памяти объекты и сцены загружаются благодаря той же системе сериализации. Данная система соотносит ресурсы, которые находятся в скомпилированном пакете, с выгруженными и загруженными объектами сцены в памяти.